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實(shí)時(shí)熒光定量PCR詳細(xì)介紹

更新時(shí)間:2025-12-22

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  實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,通過(guò)熒光化學(xué)物質(zhì)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的技術(shù),可對(duì)特定核酸序列進(jìn)行定量分析。
 
  一、檢測(cè)原理
 
  實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)合了PCR技術(shù)和實(shí)時(shí)熒光檢測(cè)技術(shù),在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)的變化實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR擴(kuò)增反應(yīng)中每一個(gè)循環(huán)擴(kuò)增產(chǎn)物量的變化。通過(guò)Ct值(擴(kuò)增產(chǎn)物的熒光信號(hào)達(dá)到設(shè)定的閾值時(shí)所經(jīng)過(guò)的擴(kuò)增循環(huán)次數(shù))和標(biāo)準(zhǔn)曲線的分析,對(duì)起始模板進(jìn)行定量分析。
 
  二、熒光標(biāo)記物
 
  實(shí)時(shí)熒光定量PCR常用的熒光標(biāo)記物包括熒光探針和熒光染料:
 
  熒光探針:
 
  TaqMan熒光探針:在探針的5'端設(shè)計(jì)有報(bào)告基團(tuán),3'端設(shè)計(jì)有淬滅基團(tuán)。當(dāng)報(bào)告基團(tuán)接近淬滅基團(tuán)時(shí),不會(huì)檢測(cè)到熒光信號(hào)。在PCR反應(yīng)時(shí),寡核苷酸兩個(gè)基團(tuán)分離,即可檢測(cè)到熒光信號(hào),并與PCR產(chǎn)物同步。新型TaqMan-MGB探針使該技術(shù)既可進(jìn)行基因定量分析,又可分析基因突變(SNP)。
 
  分子信標(biāo):一種在5'和3'末端自身形成一個(gè)8個(gè)堿基左右的發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖環(huán)雙標(biāo)記寡核苷酸探針,兩端的核酸序列互補(bǔ)配對(duì),導(dǎo)致熒光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)緊緊靠近,不會(huì)產(chǎn)生熒光。當(dāng)與核酸靶分子雜交后,構(gòu)象發(fā)生變化而發(fā)出熒光。
 
  熒光染料:
 
  SYBR熒光染料:在PCR反應(yīng)體系中加入過(guò)量SYBR熒光染料,該染料特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后,發(fā)出熒光信號(hào),未摻入鏈中的SYBR染料分子不發(fā)出任何熒光信號(hào)。因此,PCR產(chǎn)物越多,熒光越強(qiáng),熒光信號(hào)的增加與PCR產(chǎn)物的增加同步。SYBR Green法可以用于各種擴(kuò)增產(chǎn)物的定量,只要最后產(chǎn)物是雙鏈DNA,這既是其主要優(yōu)點(diǎn),也是主要的缺陷,即不能區(qū)分?jǐn)U增產(chǎn)物的特異性。
 
  三、優(yōu)勢(shì)
 
  與普通PCR相比,實(shí)時(shí)熒光定量PCR具有許多優(yōu)點(diǎn):
 
  定量準(zhǔn)確:克服了傳統(tǒng)的基于反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行定量的缺陷,避免了酶活性差異對(duì)定量結(jié)果的影響,使對(duì)原始模板的定量更準(zhǔn)確,而且結(jié)果重現(xiàn)性好,定量范圍寬。
 
  操作簡(jiǎn)便:整個(gè)PCR過(guò)程可實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化,且耗時(shí)短,操作方便,不易污染。實(shí)時(shí)熒光定量PCR在加樣后的過(guò)程完成閉管操作,不需要PCR后處理,使該技術(shù)更簡(jiǎn)單、更快速、操作更安全、假陽(yáng)性率更低,因此結(jié)果更可靠。
 
  結(jié)果直觀:儀器在線式實(shí)時(shí)檢測(cè),結(jié)果直觀,避免人為判斷的失誤,結(jié)果數(shù)據(jù)可長(zhǎng)期保存。
 
  四、用途
 
  實(shí)時(shí)熒光定量PCR可應(yīng)用于多個(gè)領(lǐng)域:
 
  病原體檢測(cè):常用于病毒載量測(cè)定,如乙型肝炎病毒、人類免疫缺陷病毒等的定量分析。
 
  基因表達(dá)分析:可比較不同組織或條件下特定基因的轉(zhuǎn)錄水平差異,研究基因表達(dá)的情況,即該基因在不同生理階段的變化趨勢(shì)。
 
  遺傳病診斷:能檢測(cè)基因拷貝數(shù)變異,如脊髓性肌萎縮癥的SMN1基因缺失。
 
  腫瘤標(biāo)志物檢測(cè):如乳腺癌HER2基因擴(kuò)增分析。
 
  其他領(lǐng)域:還可用于轉(zhuǎn)基因成分鑒定、微生物群落定量、法醫(yī)學(xué)、群體生物學(xué)及免疫學(xué)研究等。

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